molbiolrf | Unsorted

Telegram-канал molbiolrf - Молбиол, биоинформатика, life science

5348

Статьи, лекции, учебники, пособия, протоколы, софт, вакансии, инф-ция о различных мероприятиях (конференции, воркшопы, школы). По всем вопросам (в т.ч. рекламе) обращаться: @lopatushka. Чат канала: https://t.me/molbiolrf_chat

Subscribe to a channel

Молбиол, биоинформатика, life science

— Сейчас статистику посчитаем, а потом гипотезу придумаем!
— Почему бы не убрать все выбросы? И p-value маленьким станет...
— Давай проведем побольше тестов и выберем тот, где результат значим?

🚩 Если вас не смущают такие фразы, то это красный флаг 🚩

И сигнал, что в пятницу 12 сентября в 18:30 (мск) однозначно стоит посетить встречу с преподавателем R и статистики Еленой Убогоевой.

Спикер расскажет про статистические манипуляции, нелепицы и заблуждения, вызывающие мурашки по коже и фейспалм у профессионалов. Самое волнующее — разговор про НОРМАЛЬНОСТЬ. Что если ваши данные не нормально распределены: какой тест брать? идти в непараметрику? как интерпретировать результат?

Вебинар подойдет тем, кто:
📌 стремится избегать p-хакинга, черри пикинга и прочего мошенничества
📌 готов впитывать практические советы от экспертов, которые набили шишки
📌 сам профессионал, но ищет место для дискуссий
🔗 Регистрация в боте: clck.ru/3PA8wp

Ссылка на трансляцию придет за час до старта

Встреча проходит в рамках лектория «Академия Статистики». Учись статистике целый месяц бесплатно на канале @blastim и узнай, как обрабатывать свои данные.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🍁 Бластим открывает осенний лекторий «Академия Статистики»

И уже в эту пятницу 5 сентября в 19:00 (мск) состоится первая встреча серии, где статистики @blastim проведут LIVE-разбор реальных датасетов и покажут типичные ошибки в анализе данных, к которым придираются рецензенты. Вместе со слушателями эксперты степ бай степ пройдут весь путь от сырых табличек до красивых графиков и проверки гипотез.

На повестке дня:

😱 Данные о выгорании среди научных сотрудников — эксклюзив от Анастасии Дмитриевны из «АДового рисёрча». Как думаете, что сегодня испытывают ученые: непрерывная усталость, хронический стресс или всё вместе? А кому на Руси жить хорошо?
🦠 Таблица о нейтрализации вируса SARS-CoV

Можно просто подключиться и послушать, чем занимаются коллеги, а можно повторять код за спикерами в прямом эфире. Будет настоящий класс по программированию на R, полезные практические советы и ответы на ваши вопросы.


Спикеры:

📌 Дарья Бородко, биоинформатик, сотрудник НИИ общей патологии, специалист в эпигенетике и анализе древней ДНКи
📌 Елена Рыбина, научный сотрудник лаборатории когнитивной психологии НИУ ВШЭ, эксперт в области методологии исследований и статистике на R

➡️ Зарегистрироваться на вебинар можно в боте: clck.ru/3P2WQj
[Там же лежит полное расписание лектория]

🔗 Ссылка для подключения придет в бот за час до старта

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Ваши данные не должны ждать в чужой очереди 🙅‍♂️

Результаты NGS-экспериментов уже лежат на диске, но у лабного биоинформатика свой «список приоритетов»? Когда дойдет дело до ваших ридов, никто не знает. Такими темпами конкурирующая группа вас точно заскупит... Или вы пишете грант и понимаете, что NGS-анализ сделал бы его сильнее? Только вот реализовать это некому...

Если вы устали зависеть от чужой помощи, курс «Анализ NGS-данных» от @blastim станет палочкой-выручалочкой. На нем вы погрузитесь во все ключевые направления работы с данными секвенирования 2 и даже 3 поколения и сразу примените знания на своих задачах.

С чем разберетесь
• QC и картированием ридов
• Анализом данных WGS и WES
• Сборкой геномов и филогенетикой
• Мета- и эпигеномикой
• RNA-seq и single-cell

Почему именно курс от Бластим ❗️
• Преподаватели — практикующие биоинформатики из топ-вузов
• Почти 400 выпускников за 3 года
• Диплом гособразца
• Формат обучения очно в Москве или онлайн
• Поддержка кураторов и комьюнити выпускников навсегда

🔗 Все детали и программа: agency.blastim.ru/ngs

🎁 Для подписчиков канала действует промокод MOLBIOLRF на скидку 10%

Пора взять свой проект под свои пальцы

P.S: Сейчас проходит розыгрыш гранта от Кситест на бесплатное обучение на курсе «Анализ NGS-данных» от Blastim, успейте принять участие, заполнив форму 👈

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🔬🧬 ВНИИСБ приглашает на XXV Всероссийскую молодежную конференцию
С 17 по 21 ноября 2025 года ФГБНУ ВНИИСБ проводит XXV Всероссийскую молодежную научную конференцию с международным участием «Биотехнология в растениеводстве, животноводстве и сельскохозяйственной микробиологии».

В рамках мероприятия также пройдут Школа молодых ученых и конференция «Твердая пшеница»
Конференция станет площадкой для обсуждения новейших геномных технологий, изучения генетических ресурсов, устойчивости растений к стрессам и практического применения биотехнологий в АПК.
Участники Школы молодых ученых познакомятся с современными методами биотехнологии, освоят практические навыки работы на новейших приборах, пообщаются с представителями реального сектора экономики.

Для участия в Школе пройдет конкурсный отбор по мотивационным письмам.

📆 Регистрация и подача тезисов открыты до 3 ноября 2025 года на сайте: agrobiotech.timepad.ru.

🔎 Подробности – на официальном сайте ВНИИСБ и в соцсетях: ВКонтакте, Telegram.

Оргомитет:
conf.vniisb@yandex.ru.

Предварительная программа и условия участия в 1-м информационном письме

Присоединяйтесь к нам и представьте свои исследования научному сообществу!

 

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

List of protocols about cell and molecular biology from Addgene: https://www.addgene.org/protocols/

#мокрая_биология
#протокол

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Различные виды контаминации клеточных культур #мануал

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🔥 Для тех, кто хочет развиваться

Научно-технологический университет «Сириус» приглашает к поступлению на передовую программу магистратуры по биоинформатике.

У нас собраны уникальные возможности для абитуриентов, которые хотят стать настоящими профессионалами своего дела. Наши студенты с первых дней становятся частью ведущих научных команд страны.

Подать документы в магистратуру можно уже сейчас, не дожидаясь получения диплома, — для этого достаточно приложить справку о том, что вы являетесь студентом.

Подробнее на сайте.
Ещё подробнее — напиши Михаилу @mishakula.
Задать вопрос преподавателю или магистранту.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🔥 Для тех, кто хочет развиваться

Научно-технологический университет «Сириус» приглашает к поступлению на передовую программу магистратуры по биоинформатике.

У нас собраны уникальные возможности для абитуриентов, которые хотят стать настоящими профессионалами своего дела. Наши студенты с первых дней становятся частью ведущих научных команд страны.

Подать документы в магистратуру можно уже сейчас, не дожидаясь получения диплома, — для этого достаточно приложить справку о том, что вы являетесь студентом.

Большее информации на сайте.
Также ваши вопросы можно задать к.б.н. Михаилу Куляшову, доценту направления "Вычислительная биоинформатика": @mishakula.
Задать вопрос преподавателю или магистранту в группе.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Ваше лето — святое 😎 И Бластим это ценит

Поэтому команда @blastim сделала курс «Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач» специально для тех, кто хочет быть на фронтире науки, но и не упустить летний отдых:

Учитесь в отпуске/на даче/когда удобно — записи занятий навсегда, гибкий график по домашкам
Самые актуальные темы суперпонятным языком — бэкпроп, дропаут, аттеншн, эмбеддинги прочно войдут в ваш обиход
Разбор на практике всех популярных методов — от линейной регрессии до вариационных автоэнкодеров, диффузионных моделей и LLM
Бессрочный чат — поддержка от комьюнити даже через год
Море биологии — работа с базами данных NCBI и Ensembl, модели для NGS и single cell + Evo2, AlphaFold
Реальные инструменты — деплой моделей в Telegram-бота, анализ биомедицинских данных, полезный Python (sklearn, pytorch, biopython)
Крутые преподаватели из Helmholtz Munich, OpenAI, Сколтеха — асы в биоинформатике и ИИ

💎 Что на выходе:
· Готовые проекты для портфолио на GitHub
· Навыки от pandas до нейросетей + создание ИИ-агентов
· Диплом гособразца о повышении квалификации

🔗 Курс стартовал уже вчера, 8 июля, но есть возможность запрыгнуть в последний вагон. Подробнее и регистрация: https://agency.blastim.ru/pythonandml

🛍 Приведите друга — получите по 10% скидки каждому

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Приглашаем на IV Международную конференцию «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов» (IV GMMMC 2025)

📅 Даты: 25-26 октября 2025
📍 Место проведения: Сколковский институт науки и технологий, Москва (Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар, д. 30, стр. 1)
🌐 Сайт конференции: studymeta.ru/gmmmc2025

На конференции выступит Антон Чугунов — сооснователь и главный редактор научно-популярного журнала «Биомолекула».

Если вы исследователь в области метагеномики, молекулярной биологии, генетики и биохимии микроорганизмов, хотите поделиться своей работой и обменяться опытом с ведущими учеными, ждем вас в Сколковском институте науки и технологий!
Рабочие языки конференции — русский и английский.

В программе два насыщенных дня:
— пленарные лекции ведущих специалистов
— устные и постерные сессии
— неформальное общение во время кофе-брейков
— дополнительная интересная программа

К участию приглашаются студенты, аспиранты и ученые.

Зарегистрироваться и подать заявку на доклады и тезисы можно на сайте: studymeta.ru/gmmmc2025#rec884801032
⏰ Дедлайн подачи тезисов — 31 июля 2025 года.

Не упустите возможность стать частью научного события!

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧬 25 июня исследователи Google DeepMind выпустили новую AI-модель AlphaGenome

Этот инструмент умеет только по одной последовательности ДНК предсказывать разные функциональные характеристики — сайты сплайсинга, экспрессию генов, структуру хроматина и др. Но самое важное — оценивать влияние на них мутаций в некодирующих районах, которые очень часто ассоциированы с наследственными болезнями и развитием рака. Про них ученые мало что знают. Получается, перед нами прорыв в понимании «темной материи» генома или всё-таки эта AI-модель — очередная пустышка?

🔥 Давайте попробуем разобраться вместе! В это воскресенье 29 июня в 18:00 мск @blastim проводит открытый онлайн-семинар, где биоинформатик и машинлернер Александр Декан сделает обзор передовой модели от Google, сравнит ее с другими нашумевшими AI-тулами и даже покажет, как ей можно пользоваться прямо сейчас.

🔗 Записывайтесь на встречу: https://sbsite.pro//5day_marathone_1

Точно будет полезно естественникам, айтишникам и всем интересующимся сферой AI для биоинформатики. Пожалуй, лучший вариант провести летний воскресный вечер 😎

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Отличный тутуриал о том, как выделять, считать и измерять интенсивность foci при анализе данных микроскопии: https://www.youtube.com/watch?v=5z-BhcpiXp0

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Ну разве кому-то в науке интересны отрицательные результаты? Что гипотеза не подтвердилась, а p-value больше 0.05, что полный провал и облом? Журналам подавай только громкие открытия, красивые картинки, да выводы-конфетки. И желательно всё приправленное новомодными словечками: машинное обучение и искусственный интеллект...

❗️@blastim решил сделать то, на что другие закрывают глаза:

В эту среду 25 июня в 19:00 (МСК)
состоится честный и откровенный разговор «Как НЕ решить вашу задачу с помощью машинного обучения» с опытным биоинформатиком Владимиром Шитовым.

Спикер покажет:

📌 Когда ML бесполезно, а то и вредно
📌 Худшие практики, которые гарантированно позволят вам сделать лажу в красивой обёртке
📌 Реальные кейсы, где всё пошло не так

Всё это на примерах из реальной практики single-cell: вы узнаете про Foundation model в транскриптомике, UMAP, t-SNE и другие методы

📲 Записаться на встречу по ссылке: https://sbsite.pro//5day_marathone_1

После регистрации вы попадаете в закрытый чат, где будет проходить неделя машинного обучения от Бластим — это еще больше фактов об ML, о которых вам никто больше не поведает!

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

John Wiley & Sons Current Protocols in Molecular Biology

#протокол
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Актуальные исследования, аналитика, интервью с ведущими специалистами и новые подходы в диагностике — всё это собрано в телеграм-канале PCR.NEWS. Это надёжный источник информации для тех, кто учится или работает в сфере естественных наук — от студентов профильных вузов до руководителей лабораторий и экспертов в индустрии.

Регулярные форматы вроде «Утреннего кофе» и «Воскресного чтения» помогают быстро ознакомиться со свежими новостями, а за подробностями стоит обратиться к разделу «Новости». «Эпиддайджест» ориентирован на эпидемиологов, инфекционистов и всех, кто работает с общественным здоровьем. «Вопросы и ответы» — рубрика для тех, кто ценит строгость научного подхода и при этом доступную подачу сложных тем.

Особое место занимают и другие регулярные рубрики. «Бизнес-среда» — о биотехнологических компаниях, стартапах, инвестициях и индустриальных трендах. Спецпроект «Завлабы» рассказывает о жизни и работе лидеров научных коллективов, а «Наука в лицах» знакомит с биографией выдающихся учёных нашей страны.

Подписаться на PCR.NEWS — значит быть в курсе того, что действительно важно для науки и медицины.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

⚡️ Друзья! Научный клуб ФББ с мощным камбэком врывается в новый сезон! Наша новая онлайн-лекция состоится уже совсем скоро! Будем говорить о нейроинтерфейсах.

📅 Дата и время: 11 сентября (четверг), 19:00 мск.
✅ Лектор — Носов Георгий Андреевич, научный сотрудник Федерального Центра Мозга, научный сотрудник LIFT центра, руководитель магистратуры «Нейрокампуса», доцент МФТИ, PhD, кандидат биологических наук.
Тема лекции — Neurointerfaces vs. Neurointerphases. Как договориться с нейронами?

❗️ Чтобы присоединиться к лекции, подключайтесь к виртуальной аудитории по ссылке: Lv.fbb.msu.ru/sciclub. Установка дополнительных программ не требуется, просто переходите по ссылке и выбирайте режим слушателя или с микрофоном, если вы хотите задавать вопросы голосом. Также будет вестись трансляция на Youtube по ссылке: Lv.fbb.msu.ru/sciclubyt. Запись лекции будет впоследствии выложена на нашей science_club_fbb/all">странице в VK и канале в Rutube.
Будем благодарны за распространение информации о мероприятии! 🙏

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧬Вебинар от GeneScript про использование AI в молекулярной биологии. Ссылка на регистрацию.

#вебинар

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Принесла вам пару гайдов о том, как писать хорошие научные статьи

За ссылки спасибо моему менеджеру из лондонского Хуавея Измаилу (Ismail Elezi), он делился этими ссылками с нами, когда мы писали тексты статей к ICCV и NeurIPS. Эти гайды — не про то, как делать хороший рисерч, а именно как написать научную статью по своему исследованию так, чтобы было понятно, грамотно и убедительно. Даже самая умное и классное исследование легко может получить реджект на конференции, если статья написана так себе, поэтому это очень и очень важная часть работы рисерчера.

Итак, ссылки:
1. Пост на Medium: "black_51980/writing-a-good-scientific-paper-c0f8af480c91">Writing a good scientific paper" авторства Michael J. Black. Тут о том, что обязательно должно быть в статье, какими должны быть эксперименты, а также важные моменты, на которые нужно обратить внимание, о каждом из разделов статьи от Title до Supplementary.
2. В этом доке собраны несколько общих важных моментов относительно структуры статьи, стиля и грамматики. А еще даны ссылки на гайд по answering reviewer's comments и additional guidelines for scientific writing
3. Paper writing tips'n'tricks — док, который собрали Измаил и его бывший менеджер из Nvidia Aljosa Osep. Тут — о том, с чего начинать писать статью, важные моменты по каждому из разделов статьи, какие бывают частые ошибки и что делать, если дедлайн вот-вот, а написано почти ничего. И еще много ссылок на другие материалы по написанию статей в конце дока.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Virology blog: https://virology.ws/2011/01/13/multiplicity-of-infection/

#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Different protocols from Santa Cruz: https://www.scbt.com/resources/protocols

#мокрая_биология
#протокол

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Я ничего не успеваю!

Как часто вы говорите это сами себе, но не решаете проблему?

В большинстве случаев причина в потерянном времени на рутину:
📥скачивание и сортировка файлов
📊 копипаст в таблички
📨ответы на однотипные сообщения

Но есть хорошая новость: все это можно автоматизировать и для этого не нужно быть программистом — есть доступная платформа и навык, которому можно быстро научится с грамотным наставником.

На мини-курсе от @blastim вы научитесь собирать ИИ-агентов на n8n за 3 занятия и без строчки кода:

Это не теоретические занятия, а наглядное пособие с поддержкой специалиста

Теперь вместо хаоса — порядок, а вместо «я не успеваю» — «оно уже сделано»

👨‍💼 Лектор: Дмитрий Безжовчий, ИИ-специалист с 7+ лет опыта
📅 Формат: 3 занятия + чат с преподавателем + практические инструкции и гайды
💡 Стоимость: 4900₽

Если сомневаетесь в необходимости курса, то попробуйте бота-помощника, который может:

📝 Транскрибировать аудио/видео в текст
🔍 Анализировать содержание разговоров
💬 Общаться с вами как AI-ассистент
🗣 Позволяет обсуждать результаты анализа

Доступ к боту: clck.ru/3NQYvs

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🔥EMBO practical course:

gROUNDbreaking approaches for advancing circRNA research: detection, function, therapeutics. Регистрация: https://meetings.embo.org/event/25-circ-rna

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Классический #учебник по иммунологии

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

📰 Открыта регистрация на OpenBio-2025!

Мы приглашаем всех, кто интересуется актуальными направлениями биоинформатики, биотехнологий и биомедицины, стать участником мероприятия 2025 года (с 23 по 26 сентября)!

Если вы студент, молодой ученый, исследователь или практикующий специалист до 35 лет, готовый поделиться своим опытом и новыми идеями, эта конференция для вас!

Вы сможете представить свои исследования в одной из шести актуальных секций:

🦠 Вирусология

🧪 Биоинформатика

💉 Фундаментальная медицина

🔬 Биотехнология

🧫 Биофизика

🧬 Молекулярная биология

Подробное описание каждой секции вы найдёте ЗДЕСЬ.

Формы участия:
• Очное выступление
• Онлайн-выступление
• Заочное участие

🔺Участие в OpenBioэто шанс заявить о себе в научном сообществе, расширить контакты и получить поддержку ведущих экспертов.

✅ Отобранные тезисы будут опубликованы в сборнике конференции, размещены в научной электронной библиотеке eLIBRARY с индексацией в РИНЦ и присвоением DOI каждому тезису, допущенному до публикации в сборнике.

Хотите быть в центре научных открытий? Подать тезисы для участия в конференции можно до 1 августа 2025 года.

➡️  ПОДАТЬ ТЕЗИСЫ ЗДЕСЬ

📰 Подписаться на канал конференции чтобы быть в курсе всех новостей можно здесь

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Статья от Nature о проблемах трудоустройства после получения докторской степени

#карьера

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Genomics of Drug Sensitivity in Cancer database: https://www.cancerrxgene.org/

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Уважаемые подписчики!

Мы подготовили для вас подборку проверенных Telegram-каналов, посвящённых науке и образованию. В неё вошли ресурсы с качественным, актуальным и полезным контентом для студентов, преподавателей и всех, кто интересуется современными научными знаниями.

📌 Ссылка на подборку:
http://t.me/addlist/-1bv_sbXXmhhMGUy

Будем рады, если данная подборка окажется для вас полезной.

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Molecular cloning guide от NEB

#протокол
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Боишься, что тебя уволит Гендир? Скорее это сделает GenAI

AI-агенты — это главный тренд в сфере искусственного интеллекта в 2025 году. Агенты способны автономно выполняют массу работы: поддержка клиентов, отчётность, аналитика и даже принятие сложных бизнес-решений. Это не просто чат-боты, отвечающие на вопросы, а полноценные сотрудники, способные заменить реальных людей. Они пришли всерьез и надолго.

Страшно, что тебя заменит AI? Лови страховку: научись сам делать AI-агентов и даже зарабатывать на них. Крутые и стоящие заказы на создание AI-помощников от топовых компаний России (Газпром, Сибур, Росатом) уже сейчас размещаются на платформе «Профессионалы 4.0».

👥 Ты тоже можешь туда попасть — сразу после AI-курса от команды @blastim, который стартовал уже 17 июня. Но вы всё ещё можете успеть присоединиться🔥

Что ты получаешь:
➤ Все ключевые ИИ-сервисы для науки и бизнеса
➤ Навыки создания AI-агентов на основе LLM (ChatGPT и прочие)
➤ Понимание архитектуры и логики работы «умных» помощников
➤ Проекты в портфолио и доступ к непубличным задачам на П4.0
➤ Поддержку и работу в команде опытных ML-инженеров
➤ Вход в элитное AI-сообщество с реальными кейсами

🛠 После курса ты выходишь с полным пониманием и шаблонами, как создавать своих агентов и монетизировать свои навыки. Преподаватели Бластим объясняют на практике, без стресса, (почти) без кода

Активируй промокод AIMOLBIOL  на скидку 10%.

🚨 Запрыгнуть в последний вагон

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🦇🦠Хотите попробовать себя в роли вирус-хантера?

Представьте:
— Пещера в горах, летучие мыши, сбор образцов.
— Лаборатория, извлечение РНК, подготовка к секвенированию.
— Тысячи гигабайт данных, биоинформатика, аннотация новых вирусных геномов.
— А потом — филогенетика, изучение скорости эволюции вирусного генома, рецепторное моделирование, поиск "тех самых" коронавирусов, способных перейти к человеку…

Это — обычный рабочий день вирус-хантеров. Так называют вирусологов, которые ищут новые вирусы в дикой природе, чтобы опередить будущие пандемии. Их работа — важнейшая часть глобальной биобезопасности.

В России таким вирус-хантингом занимается команда Сергея Альховского. Именно они во время пандемии COVID-19 обнаружили на юге страны ближайших родственников SARS-CoV-2 — коронавирусы Хоста-1 и Хоста-2. Всего в регионе найдено уже пять новых коронавирусов, и это только начало. Все открытия опубликованы в рецензируемых журналах, включая Viruses и Nature.

❓Хотите знать, как это происходит?
❓Какие вирусы сейчас ищут?
❓Какие патогены потенциально могут стать новой Disease X?

Подписывайтесь на канал Вирусофобия
авторский блог вирусологов Сергея Альховского и его команды.

Читать полностью…
Subscribe to a channel