Молбиол, биоинформатика, life science

12 June 2025 07:55

22 июня, Москва, 15.00-16.30. Лекция Михаила Гельфанда «Генетическая одиссея, или тиндер для кроманьонца». Регистрация по ссылке.

#лекция
#научпоп

Молбиол, биоинформатика, life science

09 June 2025 11:35

Друзья!

Этот канал существует уже почти 6 лет. С самого начала я задумывала его как пространство для поддержки научного сообщества — чтобы делиться полезными материалами и идеями в области клеточной и молекулярной биологии.

С недавнего времени появилась мысль развивать формат: проводить регулярные онлайн-встречи в Zoom, где учёные, аспиранты и постдоки смогут рассказывать о своих исследованиях, а также обсуждать статьи в формате journal club — в таких темах, как молекулярная биология, клеточная биология, биоинформатика.

💬 Что вы думаете о таком формате? Было бы вам интересно участвовать (см. опрос ниже).

Молбиол, биоинформатика, life science

08 June 2025 11:05

💊🎓 «Промышленная фармация» — новая магистерская программа Новосибирского госуниверситета, где готовят специалистов по разработке инновационных продуктов для фармы и биотеха. Хочешь создавать лекарства будущего и решать реальные задачи от топовых фармкомпаний? Записывайся на вебинар и узнай, как поступить уже в этом году!

Задача программы — научить выпускников разрабатывать перспективные молекулы, в том числе с использованием ИИ, создавать передовые биомедицинские препараты (прежде всего биотехнологические, генотерапевтические и клеточные), а также разбираться во всех стадиях высокотехнологичной фарминдустрии — от создания лекарственной молекулы и проведения доклинических исследований до масштабирования на производстве.

Почему «Промышленная фармация» НГУ — это круто❓

🔴 Это сетевая программа, которую НГУ реализует совместно с Инженерной школой МГУ им М.В. Ломоносова.

🔴 Индустриальные партнеры программы — «Генериум» и «Фармстандарт», ведущие фармкомпании на российском рынке, и в процессе учебы ты сможешь работать над их реальными проектами. Также партнеры обеспечили целевые места для поступающих.

🔴 Это единственная за Уралом возможность учиться на специалиста в сфере фармразработки и создания инновационных биомедтех-препаратов без отрыва от лицензированного по GMP производства — прямо в университете. Сейчас на территории кампуса НГУ завершается строительство нового учебно-научного центра Института медицины и медицинских технологий (ИММТ) и научно-исследовательского центра — там ты сможешь нарабатывать практику на опытно-промышленном производстве лекарственных средств.

🎯 Кому подойдет программа?

Выпускникам бакалавриата по естественно-научным направлениям — биологии, химии, медицине.

💬 Хочешь узнать подробности и задать вопросы?

Тогда приходи на ▶️ онлайн-встречу, где руководители программы от НГУ и представители компании «Генериум», индустриального партнера, расскажут про все плюсы, минусы, подводные камни, а также ответят на любые вопросы.

🗓 Когда и где: 18 июня, 12.00 (мск), ОНЛАЙН.
👉 Регистрация по ссылке.

Даже если не сможете подключиться в это время, все равно регистрируйтесь — мы по запросу пришлем запись.

В этом году стартует первый набор магистрантов — возьмут всего 20 человек. Не упусти свой шанс! 🆒

@nsuniversity

Молбиол, биоинформатика, life science

04 June 2025 17:21

Tutorial about Statistics in R: https://rstats4ag.org/preface.html#what-is-this-text

Молбиол, биоинформатика, life science

20 May 2025 16:40

Не умеете программировать или пишете франкенкод? Не чувствуете себя уверенно в анализе данных и проверке гипотез, а от слова "гетероскедастичность" бросает в дрожь? Вы получили сырой датасет в эксперименте, но не знаете, что делать с ним дальше?

Через неделю, 26 мая, стартует курс «Статистика, R и анализ данных» от коллег из @blastim — отличная опция для мокрых биологов и других ученых погрузиться в мир Data Science. Здесь вы прокачаетесь в программировании, узнаете о подводных камнях статтестов, научитесь быстро находить и осваивать нужные пакеты и библиотеки.

🔗 Подробнее: https://agency.blastim.ru/stat_r

На курсе вы:
▫️ освоите базовый R и tidyverse с нуля для обработки данных
▫️ научитесь строить высокоуровневые графики и интерактивные отчеты
▫️ узнаете всё о хороших научных практиках планирования экспериментов
▫️ получите системный взгляд на статистических тесты и их взаимосвязь
▫️ сможете углубиться в анализ NGS и машинное обучение

Будет полезно как новичкам, так и прошаренным — для них будут материалы сверх программы и продвинутые фишки (уровня Advanced R Уикхэма)

❗️Ключевое преимущество: на занятия можно приносить свои сырые данные и обработать их под руководством преподавателей, получив помощь и ценные советы ❗️

📅 Курс будет проходить неделю 26–30 мая + 7–8 и 14–15 июня очно в Москве и онлайн (записи занятий остаются у вас). Первый демо-урок с преподавателем Иваном Поздняковым уже доступен: смотреть

🔥 Спецпредложение: до 23 мая скидка 10% по промокоду MOLBIOLSTAT

По вопросам о курсе: @varvara_blastim

На т-тесте статистика клином не сошлась 😏

Молбиол, биоинформатика, life science

11 May 2025 20:13

Git and GitHub for R users

Если вы достаточно уверенно пишете код R для проведения анализа, но результаты исследований и код становятся все больше или вам необходимо работать в команде, отслеживать версии, то без Git вам не обойтись. Для тех, кто работает на R, обычно рекомендуют книгу Happy Git and GitHub for the useR, однако есть ли что-то вводное, но может быть не столь всеобъемлющее? Например,в качестве такого источника существует курс Reproducible and Trustworthy Workflows for Data Science или курс An R reproducibility toolkit for the practical researcher.

Nicola Rennie создала небольшую страничку Git and GitHub for R users с презентацией, примерами и упражнениями по Git, которая также может быть полезной. Есть и запись видео.

Молбиол, биоинформатика, life science

09 May 2025 15:43

#job #technion #biology нейробиология на рыбках

Молбиол, биоинформатика, life science

29 April 2025 11:50

🤑 Хотите увидеть зарплатные вилки в биотехе, которые скрывают компании? А научиться программировать и анализировать данные?

🤩 Комбо! Уже в этот вторник 29 апреля @blastim устраивает беспрецедентный воркшоп «От сырой таблицы до инсайтов: твоя первая обработка данных на R за один вечер». На бесплатной онлайн-встрече опытный статистик Иван Поздняков научит анализировать данные на примере реального датасета с зарплатами, выгруженными из карьерного портала blastim.ru

На вебинаре:

📌 Вы получите доступ к эксклюзивным данным о зп в российском биотехе, которых нет в открытом доступе
📌 Вы с нуля выучите синтаксис базового R и познакомитесь с tidyverse
📌 Вы проведете своими руками анализ зарплатных трендов под руководством Ивана, даже если никогдашеньки не кодили
📌 Вы построите свои первые графики с помощью ggplot2 и научитесь делать волшебные отчёты в Quarto
📌 Вы узнаете все скрытые тенденции рынка биотеха и полезные приемы от Ивана Позднякова

На выходе: знания о реальных зарплатах в сфере лайфсайенс и навыки программирования и анализа данных на R

❓Почему R, а не Python? R — популярнейший язык программирования, специально заточенный под анализ данных в науке. В нем широкие возможности для визуализации данных и непревзойденный инструментарий для проведения стат-тестов. Это те навыки, который полезно иметь при себе любому ученому

🗓 Когда? 29 апреля, 19:00 мск
🆓 Вход: бесплатный
🔗 Регистрация: /channel/BlastimR_bot?start=222577
🕖 Длительность: около 3 часов

Поспешите зарегистрироваться, пока все места не заняли эйчары 😏

Реклама. ООО «Бластим», erid:2VtzqwMiVR5

Молбиол, биоинформатика, life science

25 April 2025 23:31

Академическое письмо: какие времена глаголов использовать по написании статьи на Английском.

Молбиол, биоинформатика, life science

08 April 2025 08:04

Хорошая обзорная статья про EMSA: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2757439/

Молбиол, биоинформатика, life science

31 March 2025 17:15

RNA isolation protocols

#мануал
#мокрая_биология

Молбиол, биоинформатика, life science

24 March 2025 09:54

🧬 Есть два типа людей и... две крутые опции по питону

Язык программирования Python сейчас невероятно популярен в науке вообще и в биоинформатике в частности. Питон позволяет автоматизировать многие рутинные задачи, заниматься машинным обучением, анализом NGS, хемоинформатикой etc, а также знание пайтон постоянно встречается в требованиях к вакансиям (зайдите на blastim.ru).

Бластим предлагает биологам, медикам и всем интересующимся курсы по программированию с уклоном в биоинформатику и под разные уровни подготовки:

➤ Если вы еще новичок и никогда не кодили, хотите приобрести программистское мышление и сделать свои первые проекты для гитхаба, то для вас — курс «Python для анализа данных в науке».

Лектор курса, опытный биоинформатик и машинлернер Александр Ильин, максимально жует все темы, объясняет на понятных примерах из биологии и компьютерных игр. В ходе обучения вы освоите синтаксис и семантику языка, а также познакомитесь с самыми мастхэв библиотеками для датасайенс и биоинформатики (Numpy, Pandas, Sklearn, Biopython).

Подробности тут: clck.ru/3JQyTz Старт уже сегодня, 24 марта🔥

➤ Если же вы хотите расти, осваивать более advanced темы, решать сложные практические задачи, то вам идеально подходит курс «Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач».

Преподаватели программы: биоинформатики, машинлернеры, специалисты в области single cell Владимир Шитов и Александр Декан. На курсе знакомство с ООП, много практики с кодом и сразу все ключевые ML-алгоритмы от KNN до нейросетей. 

Ссылка: clck.ru/3JQy8t
Старт 8 июля

🤝 Независимо от того, какой курс вы выберете, на программах Бластим всегда: поддержка кураторов и технических ассистентов на занятиях и в чате, много домашек с обратной связью, диплом гособразца (а также сертификат на английском) и, конечно, нетворкинг и полезные знакомства с учеными международного уровня

💝 Для подписчиков канала на любой из курсов работает промокод: MOLBIOL

Приходите на программы и подписывайтесь на @blastim

Молбиол, биоинформатика, life science

13 March 2025 08:05

Статья о CRISPR скрининге длинных некодирующих РНК (lncRNAs): https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01203-0

#статья

Молбиол, биоинформатика, life science

11 March 2025 18:26

https://azrielifoundation.org/azrieli-fellows-news/call-for-applications-for-the-azrieli-international-visiting-phd-fellowship/


Стажировки для пхд студентов в израиле с хорошей стипедией.

Научника надо оперативно искать самому

Молбиол, биоинформатика, life science

10 March 2025 09:21

#datavis

Скинули сайт с красивым объяснением про гипотезы и всякие p. Можно воровать картинки для студентов

https://www.statsig.com/blog/hypothesis-testing-explained

Молбиол, биоинформатика, life science

10 June 2025 14:28

Друзья!

Прикрепляю google-форму для потенциальных спикеров для проведения Zoom-лекций по молекулярной и клеточной биологии, а также по биоинформатике: https://forms.gle/GZTemqgRtB2DREnaA

Молбиол, биоинформатика, life science

09 June 2025 10:15

Пакет drc на R для анализа dose-response curves (этот тип анализа используется в биологии для оценки цитотоскичности препаратов, т.к. MTT-тест). Можно использовать разные модели, сравнивать кривые между собой, а главное - сделать анализ ваших данных автоматическим.

#биоинформатика

Молбиол, биоинформатика, life science

07 June 2025 08:02

Ежедневно вам надо лопатить кучу информации, а гугляж нужной статьи занимает по многу часов? Горите новыми идеями, но тонете в бесконечном бумаготворчестве и отчетах? Нет ресурса осваивать программирование, но без него на работе царит хаос? 😫

Искусственный интеллект не решит всё за вас — но может освободить время на то, что действительно важно

Присоединяйтесь 8 июня в 18:00 мск на бесплатный практический онлайн-семинар от Бластим «Быстрый старт с ИИ». Эта встреча с ИИ-экспертами для тех, кто хочет:

♦️ освоить доступные нейросети — без подписок, VPN и кода
♦️ научиться ускоренно анализировать литературу, искать статьи, проверять гипотезы
♦️ познакомиться с ИИ-агентами и создать своего помощника
♦️ значительно урезать рутинную нагрузку и избавиться от беспорядка в данных
♦️ стать более конкурентоспособным в условиях нестабильной экономики

🔗  Регистрируйтесь на встречу по ссылке

И получите в подарок доступ к AI Call Analyzer — ИИ-ассистенту от Бластим, который превращает тяжелые аудио и видеозаписи в тексты-выжимки, находит инсайты и отвечает на вопросы

PS А если вы до сих пор думаете, что ИИ — это игрушки, то читайте пост, как нейросеть помогла биологам из Имперского Колледжа Лондона сделать открытие

Молбиол, биоинформатика, life science

24 May 2025 17:09

Нейробиолог под подозрением

Журнал Science сообщил о выводах расследования в отношении известного нейробиолога Элиэзера Маслия (Eliezer Masliah), главы отдела нейродегенеративных заболеваний в NIH. В отчёте говорится о подтверждённых случаях фальсификации изображений в ряде его работ. Сейчас более 30 публикаций находятся под проверкой, и несколько уже отозваны. Скандал затрагивает исследования болезни Альцгеймера и Паркинсона, выполненные за десятилетия.

Подробнее здесь

#новости

Молбиол, биоинформатика, life science

16 May 2025 16:27

5 альтернативных инструментов типа Biorender для создания биологических иллюстраций

Молбиол, биоинформатика, life science

09 May 2025 19:04

Обзорная статья о том, какие элементы позволяют РНК оставаться в клеточном ядре: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8632128/

#статья

Молбиол, биоинформатика, life science

30 April 2025 08:03

Fluorescent Spectrosopy and Microscopy

#учебник

Молбиол, биоинформатика, life science

28 April 2025 08:03

Как выбрать тип графика для визуализации данных.

Молбиол, биоинформатика, life science

10 April 2025 08:03

🧬 мРНК-вакцины против рака: как «генетический паспорт» опухоли превращается в лекарство?

После успеха мРНК-вакцин против COVID-19 многие ожидают прорыва в онкологии. Но как работает эта технология? Почему персонализированные вакцины — будущее борьбы с раком?

Разбираемся в деталях с кандидатом биологических наук, доцентом института естествознания и спортивных технологий МГПУ Юлией Кроповой.

Молбиол, биоинформатика, life science

07 April 2025 14:22

Советы о том, как бороться с прокрастинацией про написании статьи, тезисов и т.д.

Молбиол, биоинформатика, life science

27 March 2025 15:01

catRAPID - алгоритм предсказания взаимодействия РНК:белок. Ссылка на документацию: http://service.tartaglialab.com/static_files/shared/documentation.html

#биоинформатика

Молбиол, биоинформатика, life science

17 March 2025 18:43

Всем привет! До 30 марта идет набор на летнюю школу EMBL, очень советую податься - хорошая возможность сходить познакомиться с лабораториями если вас интересует поступление туда:)

This year’s event will take place from 14–25 July 2025 at EMBL Heidelberg, and applications are now open! The deadline to apply is 30 March 2025, and full details can be found on our website: https://www.embl.org/summerschool/

*там написано что это больше для студентов технических специальностей, но в прошлом году биологи тоже были

Молбиол, биоинформатика, life science

12 March 2025 08:07

Как написать научную статью.

Молбиол, биоинформатика, life science

11 March 2025 15:12

Гайд по типам Literature reviews

Молбиол, биоинформатика, life science

06 March 2025 16:45

Как написать research proposal