molbiolrf | Unsorted

Telegram-канал molbiolrf - Молбиол, биоинформатика, life science

5348

Статьи, лекции, учебники, пособия, протоколы, софт, вакансии, инф-ция о различных мероприятиях (конференции, воркшопы, школы). По всем вопросам (в т.ч. рекламе) обращаться: @lopatushka. Чат канала: https://t.me/molbiolrf_chat

Subscribe to a channel

Молбиол, биоинформатика, life science

Эксклюсома - новая органелла в эукариотах для изоляции чужеродной ДНК: https://nplus1.ru/blog/2024/04/03/exclusome/amp

#научпоп

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Jeffrey K. Actor - Introductory Immunology_ Basic Concepts for Interdisciplinary Applications-Academic Press (2023)

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Пособия и учебники по физиологии и медицине: https://m.vk.com/medicinebook?from=post

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Объявляем об открытии регистрации на III Международную конференцию «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (3rd International conference «Preservation and enhancement of genetic resources of microorganisms»)!

Научная программа Конференции будет освещать пять основных направлений:
- Биоразнообразие микроорганизмов природных экосистем
- Хозяйственно-ценные микроорганизмы: методы выявления и изучения
- Патогенные микроорганизмы: диагностика, изучение и проблемы борьбы
- Микробные консорциумы: особенности исследования сложных надорганизменных систем
- Накопление, хранение и систематизация микроорганизмов и информации о них

Подать тезисы можно через официальный сайт Конференции по ссылке. Регистрация открыта до 15 апреля 2024 года.


Будем рады видеть Вас в числе участников!

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Уже с 21 по 24 марта спасаем мир!

Ведь именно в эти дни на Физтехе(г. Долгопрудный) пройдет научно-индустриальный фестиваль BioTech Day, который объединит в себе топовые биотех-компании и ведущих ученых. Любой желающий сможет посетить лекции очно в МФТИ или онлайн, а также принять участие в экскурсиях на производства с открытой регистрацией с 24-го марта.

🧑‍💻 Спикеры ответят на актуальные для молодых специалистов вопросы:

- Что сейчас происходит в фарм-бизнесе?
- Как строить свою карьеру в науке и в индустрии?
- Я же физмат, зачем я нужен в фарме?

🧬 Топовые ученые, такие как Всеволод Белоусов(генеральный директор Федерального центра мозга и нейротехнологий ФМБА России), Олег Гусев(профессор Казанского федерального университета и института RIKEN, Япония), Михаил Гельфанд (вице-президент по биомед-исследованиям Сколтеха), Максим Патрушев (руководитель Курчатовского геномного центра), Павел Логачев (академик РАН и директор ИЯФ СО РАН) и другие, расскажут о своих исследованиях:

- Сравнительная геномика бактерий
- Биобудущее- стартуем сегодня
- Бор-нейтрон-захватная терапия как способ лечения рака
- Микромеханика клеток и тканевых конструктов

Миру нужен биотех — биотеху нужен ты!
Регистрируйся на событие в боте фестиваля и следи за обновлениями на сайте!

P.S. А ещё @sci_career информационный партнёр фестиваля, ура! ❤️

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

#биоинформатика
#учебник

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

До 29 февраля идет прием заявок на программу переподготовки «Биоинформатика для биологов»: bioinf.me/admission

📈 Обучение длится год, с сентября по май;
📈 Занятия проходят онлайн по субботам и вечерам рабочих дней, так что можно учиться из любой точки мира и совмещать с работой или получением основного образования;
📈Главное в программе — обилие практики с постоянной обратной связью от преподавателей и ассистентов.

Студенты изучают статистику, основы машинного обучения, учатся программировать на Python и R, работают с данными NGS и в командной строке, а также выполняют научный проект под руководством специалистов из разных лабораторий мира. Учатся оформлять CV, проходить собеседования и узнают про возможности дальнейшего трудоустройства. А в свободное от учебы время общаются друг с другом, преподавателями и кураторами 😊

Узнать больше можно сегодня, 19 февраля в 19:00 МСК на онлайн дне открытых дверей Института биоинформатики. Регистрация: bioinf.me/education/program#opendays

Ждем ваших заявок!

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

В День российской науки ностальгируем и вдохновляем новое поколение на научные свершения. Запускаем флешмоб #AIRI_вдохновляет 😁

Присоединяйтесь, рассказывайте про свою первую научную публикацию и выигрывайте призы!

Как принять участие?
→ Вспомните свою первую статью, поделитесь историей её написания и интересными фактами о работе над ней
→ Опубликуйте пост у себя на странице в социальных сетях с хештегом #AIRI_вдохновляет

🎁 Среди всех историй 19 февраля рандомайзером мы выберем пять публикаций и подарим их авторам фирменный мерч AIRI.

Ваши рассказы будут вдохновлять тех, кто только начинает свой путь в науке, и принесут пользу тем, кто сейчас пишет свои работы на схожие темы. Ждем ваши истории!

Кстати, ловите классные стикеры для Telegram 🔖

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Первая причина посмотреть этот пост — это ваша тяга к новым знаниям🤓А вторая — это новые программы обучения по биоинформатике от biomedschool.ru!

До 20 февраля действуют самые выгодные цены на практические курсы, успейте занять места по ссылкам ниже ⬇️

➡️ Вебинар «Визуализация данных»

Разбетесь, как работать с ggplot2 и создадите скрипты, которые вы сможете применить непосредственно к своим данным. После вебинара вы будете понимать как сделать информативную визуализацию для квалификационной работы, публикации, отчета или презентации.

➡️ Вебинар «Анализ качества Fast Q-файлов и исправление ошибок»

Поймете, как пользоваться программами fastQC, сutadapt и prinseqlite. Вы научитесь проводить оценку качества секвенирования и фильтровать сырые прочтения секвенатора по качеству и длине, отрезать адаптеры и праймерные последовательности. Практика во время вебинара на реальных данных секвенирования с платформы Illumina.

➡️ Курс «Введение в технологии NGS. Работа с данными секвенирования»

Вы изучите работу с базами данных, проведёте анализ результатов секвенирования и самостоятельно соберете геном, аннотируете мутации и начнёте пополнять свое портфолио реальными кейсами!

➡️ Курс «Python для анализа данных»

В отличии от его бесплатных аналогов, во время обучения вы получите структурированную информацию по основам языка и работе с библиотеками, обратную связь от преподавателей и❗️практику на примере биологических проектов.

Подробности на сайте — biomedschool.ru

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🦠Пособие про вирусные векторы от Addgene

#пособие
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🔬Все о флуоресцентных белках от Addgene

#пособие
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Ваш шанс воплотить научные амбиции в жизнь вместе с ИТМО!

Передовая инженерная школа ИТМО объявляет уникальный набор научных коллективов для получения грантов на открытие собственных магистратур, лабораторий, а также развитие продуктов и их интеграцию в компании.

— Мечтаете о собственной магистратуре?

— Планируете основать научную лабораторию?

— Мыслите масштабно и хотите создать научно-образовательный центр?

— Хотите выйти в индустрию и работать с бизнесом?

ПИШ ИТМО готов системно поддерживать и инвестировать в вас до 50 миллионов рублей!

Подавайте заявку до 30 января включительно 👉🏻 https://pish.itmo.ru/domen

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

✏️📈Как сделать научный постер?

1. Гайд о том, как сделать постер
2. Краткий гайд c шаблонами
3. Советы от Science
4. BetterPoster - сайт, где можно найти вдохновение для дизайна постера
5. Советы от MIT, а также способы, как оценить постер за 60 секунд

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Фундаментальный обзор про chromatin-remodelling complexes.

#статья

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Бодро врываемся в первую рабочую неделю года с мощной подборкой вакансий в машинном обучении 🥸

🇦🇺Постдок в пространственные омики и ML в UNSW
Обязанности: создание и тестирование ПО для анализа изображений, разработка конвейеров ML для распознавания изменений в экспрессии. Требования: PhD, опыт в омиках, визуализации одиночных молекул, знание Python, MATLAB. ЗП $106k/год. Дедлайн: 14 января

🇬🇧Специалист по ML в Open Targets
Задача: поиск в литературе информации, имеющей отношение к открытию новых лекарств, c помощью NLP. ЗП 3,5k £/мес. Дедлайн: 23 января

🇨🇭PhD-студент в вычислительную биологию в Бернский университет
Разработка машинлернинговых моделей хромосомных инверсий. Требования: сильные знания статистики, ML, популяционной генетики. Дедлайн: 1 февраля

🇳🇱Постдок в области ML в Delta Lab 2
Предстоит создавать, оценивать новые ML-модели, участвовать в конференциях. Требования: степень PhD, знание NumPy, PyTorch. ЗП 3,3k €/мес. Дедлайн: 4 февраля

🇺🇸PhD или постдок в области ИИ и биоинформатики в Университет Флориды
Предстоит применять ML-модели для биомедицинских задач. Требования: степень магистра/PhD, опыт в Python/R, желательно NGS, GWAS, мультиомике. Дедлайн: 2 апреля

🇫🇷Компьютерный генетик в InstaDeep
Задачи: анализ и интерпретация геномных данных с помощью LLM, разработка конвейеров обработки данных. Нужны: степень PhD, знания геномики, опыт в ИИ, навыки программирования на Python, R.

🇬🇧Старший хемоинформатик в BenevolentAI
Предстоит заниматься in silico драг дизайном малых молекул, управлять командой. Нужен опыт в компьютерном моделировании лекарств, навыки программирования, внедрения ML, знакомство с фреймворками глубокого обучения.

🇫🇷Исследователь в области биоинформатики и сравнительной геномики в ATLASea
Предстоит проводить сравнительный анализ геномов морских организмов, в том числе с использованием ИИ. Требования: степень PhD, знание Python, R, владение биоинформатическими тулами.

#бластим_вакансии

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Jeffrey K. Actor - Introductory Immunology_ Basic Concepts for Interdisciplinary Applications-Academic Press (2023)

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧪 Летняя школа в НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера

📌 Вы — студент медико-биологической специальности?

📌 Хотите получить опыт в научной сфере, понять важные проблемы медицины и биологии?

📌 Хотите научиться их решать, усилить свои практические навыки?

Регистрируйтесь на Летнюю школу «Наука — врачам будущего»

Когда? 8-15 июля 2024 г.
Где? г. Санкт-Петербург, Научно-исследовательский Институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера
Для кого? Для студентов медицинских и биологических специальностей (предпочтение студентам 4-6 курсов)

Прием заявок открыт до 17 мая 2024 года (включительно)

❗️УЧАСТИЕ БЕСПЛАТНОЕ

Форматы участия:
— студенты
— слушатели

Что ждёт вас на Летней школе?

➡️ знакомство с миром науки;
➡️ выполнение индивидуальных научных проектов под руководством кураторов;
➡️ защита полученных результатов на конкурсе среди участников школы;
➡️ участие в мастер-классах, квизах, квестах, журнальном клубе;
➡️ расширение рабочих связей, нетворкинг;
➡️ отличный опыт для CV, и бонусом — личные рекомендации от ведущих учёных.

Направления:

🦠 Вирусология
Поиск новых ингибиторов жизненного цикла вирусов, определение их механизма действия, спектра активности и перспектив дальнейшей разработки, генотипирование цикрулирующих вирусов.

🧫 Бактериология
Изучение чувствительности условно-патогенных микроорганизмов к антимикробным препаратам диско-диффузионным методом.

💉 Иммунология
Определение основных иммунологических маркеров и их устойчивости с помощью проточной цитометрии, ИФА, мультиплексного цитокинового анализа.

🔬 Лабораторная диагностика
Лабораторные исследования при диагностике различных заболеваний.

🧬 Молекулярная биология
Создание генетических конструкций de novo.

💻 Биоинформатика
Анализ и интерпретация больших биологических данных.

💊 Эпидемиология и основы
доказательной медицины

Оценка коллективного иммунитета и проведение молекулярно-эпидемиологических исследований.

📲 Telegram-канал школы

📲 Группа в ВК

🌐 Подробная информация и регистрация на сайте

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Канал по биоинформатике и с примерами кода: https://youtu.be/PvBf65Y8Cqk?feature=shared

#биоинформатика

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

#учебник
#биоинформатика

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Полезные ресурсы по проточной цитометрии:

https://www.biolegend.com/nl-nl/flow-cytometry/flow-cytometry-concepts/introduction-to-flow-cytometry

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/eji.201970107

https://www.thermofisher.com/us/en/home/references/protocols/cell-and-tissue-analysis/flow-cytometry-protocol.html

https://fccf.mskcc.org/protocols/cellsorting

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Ну хорошо)
Попробовала структурировать, повторений много, так что выбирайте то, что лучше и удобнее для вас:)


Самый лучший курс, смотреть в первую очередь
https://youtube.com/playlist?list=PLlb7e2G7aSpRb95_Wi7lZ-zA6fOjV3_l7

Питон:
https://stepik.org/course/67/promo
это прям самая база, многие видели, наверное

https://stepik.org/course/68343/promo

Если нужно быстро выучить/повторить, то

https://www.kaggle.com/learn/intro-to-programming
https://www.kaggle.com/learn/python

https://www.kaggle.com/learn/pandas - работа с файлами

https://www.kaggle.com/learn/data-visualization - визуализация

Если занимаетесь вычислениями, то

https://stepik.org/course/3356
Тут еще немного датасаенса в конце есть
Статистика, известный и очень крутой курс
https://stepik.org/course/76/promo

https://stepik.org/course/524/promo

Data science:

https://stepik.org/course/4852/promo
https://www.kaggle.com/learn/intro-to-machine-learning

Нейросетки: (но советую просто статьи на хабре почитать, если особой практики не было)
https://stepik.org/course/401/promo

SQL
Короткий курс: https://www.kaggle.com/learn/intro-to-sql

SQL на русском с тренажером , ОЧЕНЬ СОВЕТУЮ
(если хотите набить руку/есть время дойти до advanced уровня)
https://stepik.org/course/63054/promo

Пара статей по визуализации данных:
https://habr.com/ru/companies/otus/articles/540526/ - seaborn

https://habr.com/ru/articles/468295/ - matplotlib

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Дорогие друзья! Приглашаем вас на вебинар от PCR.NEWS

📍Тема вебинара: «Профилактические и терапевтические мРНК-вакцины: от фундаментальных исследований к применению в клинической практике»

Дата проведения:
29 февраля в 10:00
Формат: Онлайн

Создание мРНК-вакцин — одно из самых успешных инновационных направлений в современной биологии и медицине. В прошлом году лауреатами Нобелевской премии по физиологии или медицине стали Каталин Карико и Дрю Вайсман, исследования которых послужили основой для создания первых одобренных регуляторами мРНК-вакцин.

PCR.NEWS проводит научно-практический вебинар, на котором будут освещены новейшие исследования и разработки в области мРНК-вакцин от инфекционных заболеваний, а также перспективы создания вакцин от рака.

В программе заявлены доклады ведущих специалистов:
➡️ Из Университета «Сириус»,
➡️ Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого,
➡️ Института химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения РАН и других профильных учреждений.

УЧАСТИЕ БЕСПЛАТНОЕ📍Необходима предварительная регистрация https://clck.ru/38rYNP

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧫🧬Пособие про плазмиды от Addgene

#пособие
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧬Пособие про CRISPR/Cas от Addgene

#пособие
#мокрая_биология

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧬🔍Cas-OFFinder - a fast and versatile algorithm that searches for potential off-target sites of Cas9 RNA-guided endonucleases.

#биоинформатика

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

Советы о карьере в академии от Addgene

#карьера
#пособие

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🦠🖍Очень крутой канал, посвященный тому, как делать научные иллюстрации в программе Adobe Illustrator

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

✏️📖Материалы о том, как написать research proposal:

1. Структура + примеры от MIT
2. Краткая презентация по структуре и рекомендации для каждой главы
3. И еще одна памятка о структуре research proposal + советы от MIT

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

TADs do not stay in the loop

#статья
#биоинформатика

Читать полностью…

Молбиол, биоинформатика, life science

🧬🔍CD-CODE (CrowDsourcing COndensate Database and Encyclopedia) is a comprehensive, semi-manually curated crowdsourcing database of biomolecular condensates and their constituents as well as an encyclopedia for the scientific terms used to describe them. Biomolecular condensates are micron-scale compartments that selectively concentrate biomolecules, mainly proteins and nucleic acids but lack surrounding lipid membranes.

#биоинформатика

Читать полностью…
Subscribe to a channel