Бластим: курсы и работа в биотехе

29 May 2023 17:51

Заключительный практический вебинар «Обработка данных: биоинформатика и статистика» из мини-курса по микробиомике человека пройдет 31 мая в 19:00 по Москве.

Спикером будет Вера Одинцова, выпускница мехмата МГУ, руководительница отдела аналитики Knomx, преподавательница курса «анализ NGS-данных»!

На занятии вы узнаете:

— Основные этапы обработки данных от получения файла с секвенатора до оценки пропорций микробов в образцах
— Основные характеристики микробиоты (пропорции микробов, альфа- и бета- разнообразие, метаболический потенциал)
— Принципы выбора инструментов для статистического анализа данных

А также научитесь:

— Учитывать ограничения и возможности метода 16S рРНК секвенирования при планировании эксперимента
— Понимать результаты публикаций по микробиоте
— «Читать» основные виды визуализаций в публикациях

Стоимость: 2 500 руб
Записаться можно по ссылке: bit.ly/3MZkyaH

Бластим: курсы и работа в биотехе

26 May 2023 13:05

❓Как провести выходные с максимальной пользой? Приходите на большое карьерное событие — виртуальную Ярмарку вакансий Бластима в биотехе! Она состоится уже завтра, 27 мая: начало в 10:00 по Москве.

На Ярмарке выступят представители ведущих российских биотех-компаний: Нанолек, Генериум, BostonGene и других. Участники узнают о карьерных треках, открытых вакансиях, условиях работы в команде, стажировках и учебных программах, а также смогут задать вопросы потенциальным работодателям. У зарегистрировавшихся на платформе мероприятия также останутся презентации компаний-участниц со всеми контактными данными!

➡️Ознакомиться с подробностями и узнать расписание можно по ссылке: bit.ly/3MEjVly
Регистрируйтесь. Ждем всех, кто хочет найти идеальную работу в биотехе!

#бластим_карьера

Бластим: курсы и работа в биотехе

24 May 2023 18:06

🔴Трансляция уже идет!

➡️Приглашаем всех присоединиться к вебинару по микробиомике человека со Станиславом Кошечкиным: https://bit.ly/3q3J1T7

Бластим: курсы и работа в биотехе

24 May 2023 11:55

Биология — увлекательная область с множеством карьерных возможностей. Предлагаем обсудить несколько вариантов траекторий в лайфсайнс. Рассмотрим плюсы/минусы позиций, места, где можно работать, среднюю зарплату в США и Европе.

#бластим_карьера

Бластим: курсы и работа в биотехе

21 May 2023 19:07

Удивительные новости науки этой недели в обзоре Бластима!

🦋Бабочки издавна привлекают внимание не только энтомологов-любителей, но и многочисленных ученых-натуралистов. Удивительно, что эволюционная история излюбленного объекта исследования и коллекционирования стала понятна буквально недавно. 15 мая в Nature Ecology & Evolution была опубликована статья по филогении чешуекрылых. Специалисты секвенировали 391 ген почти 2300 видов бабочек, охватывающих 92% современных родов, и получили крайне любопытные результаты. Подтвердилось, что чешуекрылые эволюционировали вместе с покрытосеменными растениями, хотя и возникли на 100 млн лет позже цветковых. Выяснилось также, что бабочки произошли от предков ночных травоядных мотыльков в верхнем мелу на территории современной Северной Америки. Позже, примерно 75 млн лет назад, бабочки заселили Евразию, а затем произошла их значительная диверсификация в тропических регионах. Кроме того, сопоставив многочисленные источники, ученые предположи, что гусеницы последнего общего предка бабочек питались бобовыми растениями. Сегодня также почти 70% чешуекрылых — «однолюбы», которые предпочитают только травы семейств бобовые или злаковые, с которыми они коэволюционируют вот уже миллионы лет!
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02041-9

🧬Все-таки гребневики оказались сестринской группой по отношению ко всем остальным многоклеточным животным! К такому выводу пришли ученые в новой статье в Nature. Гребневики — организмы, внешне похожие на медуз, но отнюдь им не родственные. А еще есть губки, скажем, всем известная бадяга. Зоологи много лет дискутируют, кто дивергировал раньше всех из ветви Metazoa: примитивные губки или более продвинутые гребневики? Традиционные филогенетические подходы в этом вопросе себя исчерпали, поэтому было решено построить дерево по синтении — консервативному набору и порядку расположения генов на хромосоме. Ученые взяли геномы представителей стрекающих, губок, пластинчатых, билатерий и гребневиков, а в качестве аутгрупп добавили одноклеточных родственников животных (хоанофлагеллят и др.). Несмотря на миллионы лет независимой эволюции, губок, пластинчатых, стрекающих и билатерий объединяют уникальные хромосомные перестройки, которые отсутствуют у гребневиков. Это свидетельствует о том, что именно гребневики — самая первая группа, ответвившаяся от общего ствола животных. Результаты работы имеют принципиальное значение, особенно для понимания становления нервной системы.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05936-6

🧪Растворитель трихлорэтилен (ТХЭ) повысил риск развития паркинсонизма у группы американских ветеранов морской пехоты на 70%. Дело в том, что эти военные в 1970-80-е годы тренировались на базе Лежен в Северной Каролине, где вода была значительно загрязнена трихлорэтиленом. В литературе давно звучали подозрения об опасности молекулы, но сейчас, изучив 85 тыс. медкарт, эпидемиологи показали достаточно четкую связь между растворителем и болезнью Паркинсона. ТХЭ — легко летучая бесцветная жидкость, очень устойчивая в воде и почве. В прошлом вещество пользовалось популярностью в промышленности, применялось в химчистке, для приготовления кофе и даже анестезии. По-видимому, морпехи могли вдыхать соединение, получать его трансдермально или с пищей во время учений, ведь в воде на базе Лежен уровень ТХЭ превышал допустимый в 70 раз! Ранее нейротоксикологи на животных показали патомеханизм ТХЭ: химикат легко всасывается через кожу, проходит биомембраны и ингибирует митохондриальный комплекс I в дофаминовых нейронах мозга, что приводит к их гибели.
https://www.science.org/content/article/widely-used-chemical-strongly-linked-parkinson-s-disease

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

18 May 2023 15:05

В новой статье про современные технологии откроем для себя метод DISCOVER-Seq+. Он позволяет с высокой точностью искать офф-таргеты «генетических ножниц» CRISPR/Cas9!

#бластим_технологии

Бластим: курсы и работа в биотехе

17 May 2023 15:05

Сегодня стартует мини-курс «Исследования микробиома человека — руководство пользователя».
В 19:00 (мск) пройдет первое занятие «Сбор данных и биобанка: клинический этап». Спикер: Владимир Романов.

⭐Успейте записаться прямо сейчас и попасть на полезный вебинар: bit.ly/41Mj1bY

Бластим: курсы и работа в биотехе

16 May 2023 12:50

🕵🏻‍♂Разыскивается опытный технишн в Клонинг Фасилити!

Биотех-компания в области промышленной биотехнологии микроорганизмов ищет в команду коллегу для помощи с технической частью, требующей хороших навыков молекулярно-биологической работы, аккуратности и готовности адаптировать и улучшать новые протоколы.

Требования:
✔Обязателен опыт ежедневной работы в молекулярно-биологической лаборатории в течение нескольких лет
✔Идеальный кандидат любит оптимизировать свои работу, не боится пробовать новое, уверенно владеет базовыми методами молекулярной биологии, легко читает на английском

Условия:
▫Работа в одной из самых сильных команд в отрасли
▫Место работы: Москва, территория ИБХ РАН (м. Беляево)
▫Рыночная зарплата, определяемая в зависимости от опыта и по результатам собеседования
▫Карьерный рост и увеличение зарплаты по мере профессионального роста
▫Испытательный срок: 3 месяца
▫Оформление в штат по ТК РФ

❗Заявки принимаются до 15 июня
Ссылка на анкету: bit.ly/3IfztdV

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

15 May 2023 12:19

Бластим рекомендует научную школу от ПИШ ИТМО AGNI Workshop Week!🔥

AWW – первый формат научной школы по формуле: 1 неделя – 1 проект, где на одной площадке собираются участники из абсолютно разных областей естественных наук со всей России!

В рамках воркшопа участники подготовят свой проект по одному из трех треков, узнают о перспективных направлениях нанотехнологий, улучшат soft skills и познакомятся с коллегами по сфере.

Конкурсантам, прошедшим отбор, предоставляется бесплатное проживание и участие. Помимо этого, можно поучаствовать в конкурсе на бесплатный перелет!

Подробнее читайте в карточках и не упустите возможность подать заявку на лучшую неделю этого лета:
🔗 http://aww.itmo-agni.ru/

❗Дедлайн: 17 мая

#бластим_рекомендует

Бластим: курсы и работа в биотехе

12 May 2023 13:35

Подготовили для вас обзор приложений искусственного интеллекта в прикладных сферах от сельского хозяйства до медицины и фармы в новом материале Бластима. Обсудим, как машинное обучение, нейросети и компьютерное зрение нашли себя в биотехе.

#бластим_технологии

Бластим: курсы и работа в биотехе

11 May 2023 14:30

Собрали воедино отличные мероприятия в науке и индустрии!

📌Всероссийская школа-конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петебург)
26 — 27 июня
Дедлайн: 12 мая
bit.ly/41qWilU

📌Съезд Российского Физиологического Общества им. И.П. Павлова (Санкт-Петебург)
11 — 15 сентября
Дедлайн: 12 мая
bit.ly/3BdVwxU

📌Школа по Магнитно-Резонансной Томографии (Санкт-Петербург)
3 — 8 июля
Дедлайн: 14 мая
bit.ly/3nRcj6S

📌Мини-курс «Исследования микробиома человека — руководство пользователя» (онлайн)
17, 24, 31 мая
bit.ly/3O6s58J

📌Вебинар «Руководство для начинающих по интерпретации результатов биостатистики»
23 мая, 14:00 (мск)
bit.ly/41sxVEb

📌Виртуальная Ярмарка вакансий в биотехе
27 мая
bit.ly/42P9pyn

📌Съезд Общества физиологов растений «Биология растений в эпоху глобальных изменений климата» (Уфа)
18 — 23 сентября
Дедлайн: 31 мая
bit.ly/3O0fIL2

📌Конференция «Современные проблемы фотобиологии» (Краснодарский край и дистанционно)
10 — 17 сентября
Дедлайн: 1 июня
bit.ly/3MjF2L5

📌Международная научная конференция молодых учёных и специалистов, посвящённая 180-летию со дня рождения К.А. Тимирязева (Москва и дистанционно)
5 — 7 июня
Дедлайн: 3 июня
bit.ly/3I0MMPx

📌Всероссийская школа-конференция «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения» (Санкт-Петербург)
22 — 23 июня
Дедлайн: 5 июня
bit.ly/42sIw3d

📌Международная онлайн-конференция по сельскому хозяйству IOCAG2023
1 — 15 ноября
Дедлайн: 26 июня
bit.ly/3O13sdu

📌Конференция «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов» (Сколково)
23 — 24 сентября
Дедлайн: 1 августа
bit.ly/3O1rSng

📌Летняя школа по тропическим и инфекционным заболеваниям (Бразилия)
31 июля — 18 августа
bit.ly/42ILv7w

📌Всероссийская GMP-конференция (Екатеринбург и дистанционно)
27 — 29 сентября
bit.ly/42sjXDB

#бластим_подборка

Бластим: курсы и работа в биотехе

07 May 2023 14:38

Погружаемся в новости лайфсайнс вместе с Бластимом!

🧬22 ноября 2022 года FDA одобрило Hemgenix — первую генную терапию гемофилии B. Стоимость лечения в 3,5 млн долларов сделало препарат самым дорогим в мире. На страницах Nature авторы как раз анализируют вопрос доступности передовой терапии. Создание и производство таких лекарств обходится дороже, чем традиционных малых молекул, а ценник за лечение одного пациента может исчисляться миллионами долларов, если учитывать затраты на госпитализацию и манипуляции с клетками. Правда, некоторые специалисты считают, что генотерапия все равно выгодна, так как позволяет сэкономить на повторном лечении. Тем не менее даже в богатых странах системы здравоохранения не справляются с такими расходами. Удешевить лечение, по мнению авторов, может терапия in vivo, то есть без извлечения клеток из тела. Другой вариант — разработка платформ генной терапии: доказав безопасность и эффективность одной системы, специалисты могли бы заменять гены в отработанной конструкции под другие болезни. Успешность преодоления проблемы ценообразования определит будущее генотерапевтических препаратов.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01389-z

💉В пандемию COVID-19, которую ВОЗ недавно объявила оконченной, мРНК-вакцины против коронавируса из-за риска деградации компонентов приходилось постоянно держать в холодильнике. Избавиться от недостатков таких вакцин ученые из Baidu Research решили с помощью искусственного интеллекта. Применив алгоритм компьютерной лингвистики LinearDesign к нуклеотидной последовательности РНК, они провели оптимизацию кодонов для учета предпочтения клеток и повышения устойчивости молекул. Как известно, чем стабильнее мРНК, доставляемая в клетки, тем сильнее экспрессия антигенного белка и выработка в ответ на него антител, что в свою очередь усиливает иммунную защиту. ИИ легко подобрал РНК с жесткими двуцепочечными участками, которые в ходе валидационных испытаний на мышах вызвали иммунный ответ в 128 раз выше, чем традиционные вакцины! Алгоритм также увеличил сохранность препарата. Надеемся поскорее увидеть новые вакцины в клинике.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01487-y

☀️Чтобы повысить урожайность сельскохозяйственных культур, нужно сделать фотосинтез более эффективным. Узкое место процесса — это свойства основного фермента карбоксилирования Rubisco. У энзима низкая скорость реакций, а также он часто фиксирует кислород вместо CO2, из-за чего много энергии растрачивается на бесполезное фотодыхание. Некоторые растения, скажем, кукуруза или сахарный тростник, решают эту проблему, переходя на С4-фотосинтез. Но есть и другие механизмы концентрирования углекислоты, например, карбоксисомы. Эти специальные органеллы, где Rubisco инкапсулирован в полиэдрические белковые оболочки, характерны для микроорганизмов. Ученые решили перенести гены карбоксисом из бактерий в хлоропласты. Так, методами генной инженерии был получен транспластомный табак. В его пластидах действительно происходила самосборка функциональных карбоксисом, которые даже поддерживали фотосинтез и рост растений, но только при ненормально высокой концентрации углекислого газа. Хотя результаты свидетельствуют о необходимости оптимизации дизайна внедряемой генетической конструкции, «карбоксисомная инженерия» сулит большие перспективы для агротеха!
https://www.nature.com/articles/s41467-023-37490-0

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

04 May 2023 17:50

Как биологу использовать Python для анализа больших данных? Почему этот язык становится мастхэвом для ученых? Может ли умение кодить способствовать профессиональному росту?

Эти и многие другие вопросы обсудим на открытой встрече «Начни программировать на Python: возможности для биологов». Спикером выступит опытный преподаватель программирования и матмоделирования Александр Ильин.

Программа онлайн-лекции:

• Обзор инструментов для упрощения работы в науке: автоматизация/визуализация/машинное обучение/интеграция питона с R, MATLAB, Cytoscape
• Примеры wow-эффектов от использования Python для рутинной работы в лайфсайнс
• Частые проблемы, которые возникают при работе с Python, и будущие возможности
• Грамотный трек изучения языка для новичка
• Презентация нового курса «Python для анализа данных в науке» от Бластим и ответы на все вопросы

Ждем всех желающих начать познавать насущный питон!
До встречи 11 мая в 19:00 (мск).
Регистрация по ссылке: bit.ly/3LCIazU

#бластим_питон

Бластим: курсы и работа в биотехе

03 May 2023 16:26

Бластим провел розыгрыш призов: смотрите результаты на видео!

Теперь на почту каждому участнику придут промокоды со скидкой, которую можно реализовать на грядущие курсы Бластима. Промокоды работают до 5 мая, скидка не аддитивная.

Поздравляем всех! Это был лучший ДОД!

Бластим: курсы и работа в биотехе

02 May 2023 12:50

Вакансия химика-лаборанта в Клонинг Фасилити!

Клонинг Фасилити — российская компания, занимающаяся промышленной биотехнологией микроорганизмов. В сильную и дружную команду нужен коллега для помощи с технической работой, требующей базовых лабораторных навыков и аккуратности.

Требования:
⚗️Образование: биологическое или химическое (возможно неполное)
🌡Базовое знание органической химии и биохимии
☢️Понимание работы в лаборатории и техники безопасности
🧪Знание аналитической химии
✍️Усидчивость и сконцентрированность

Условия:
💰Зарплата от 50 000 р. на руки
📍Лаборатория в Москве на территории ИБХ РАН
📈Карьерный рост и увеличение зарплаты по мере профессионального роста
📆Испытательный срок: 3 месяца
📔Оформление в штат по Трудовому Кодексу РФ

Заявки до 15 июня (включительно)
Откликнуться: bit.ly/3Nv6u9n

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

28 May 2023 19:55

После насыщенной Ярмарки вакансий Бластима можно немного отдохнуть и почитать новости из топовых научных журналов!

❤️Испанские ученые показали важность грудного вскармливания для развития здоровых детенышей млекопитающих. Результаты семи лет трудов, включающих даже ручное доение мышей (!), опубликованы в Nature. Оказалось, что компонент материнского молока ɣ-линоленовая кислота (GLA) критически необходима для нормального созревания клеток сердца. Незаменимая жирная кислота, получаемая новорожденными мышатами с молоком, действует через ретиноидный X-рецептор на кардиомиоцитах и переключает их метаболизм с сахаров на липиды в первые сутки после появления животных на свет. Это позволяет сформироваться нормальным клеткам, которые в состоянии обеспечить интенсивную работу миокарда в течение всей жизни. В контрольных экспериментах мышата, которых кормили матери на безжировой диете, имели аномалии развития сердца и умирали в раннем возрасте. GLA содержится и в грудном молоке женщин, однако ее роль пока неясна. Тем не менее результаты имеют серьезное значение для создания терапии неонатальных сердечных патологий.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01699-2

🐥Перья из чешуи можно получить с помощью манипуляций всего с одним геном! В Science Advances вышла статья, где швейцарские исследователи благодаря внутривенным инъекциями куриным эмбрионам особых молекул-агонистов переключили известный регулятор развития животных — sonic hedgehog. Усилив его сигнальный путь, ученые смогли добиться развития на куриных лапках, в норме покрытых чешуями, настоящих пуховых перьев. Биологи давно дискутируют на тему возможной гомологии волос млекопитающих, перьев птиц, чешуи рептилий: новое исследование однозначно подкрепляет эту точку зрения. Более того, эволюционный переход между покровными структурами, по-видимому, мог происходить даже без серьезных изменений в геноме.
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adg9619

🎯Паразитирующие на растениях нематоды ежегодно наносят ущерб мировому сельскому хозяйству на сотни миллиардов долларов. Имеющийся арсенал борьбы с червями ограничен из-за низкой селективности нематицидных соединений и их высокой токсичности для нецелевой фауны. На страницах Nature обсуждается новая стратегия борьбы с паразитами. Ученые из Университета Торонто на модельном C. elegans протестировали химические молекулы имидазотиазольной природы, названные селективинами, для избавления от фитонематод. Обнаружилось, что после поглощения неактивных селективинов круглые черви метаболизируют их с помощью цитохрома P450, превращая молекулы-предшественники в летальные продукты и убивая самих себя. В экспериментах селективины показали высокую эффективность и избирательность: специалисты надеются вывести перспективные пестициды на рынок.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06105-5

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

25 May 2023 10:31

Открыта позиция химика-синтетика!

В динамично развивающуюся компанию ООО «Люмипроб Рус», ведущего производителя реагентов для молекулярной биологии и диагностики, требуются на работу научные сотрудники и сотрудники химического производства для работы в области органического синтеза.

📌Обязанности:
• проведение синтезов, очистки, анализа органических соединений (органические флуоресцентные красители, нуклеозиды, фармацевтические молекулы, реагенты для синтеза олигонуклеотидов и другие соединения) с масштабами реакций от граммовых количеств до килограммовых процессов, в зависимости от специализации и интересов сотрудника;
• воспроизведение известных процедур, совершенствование существующих методов синтеза и разработка новых;
• ведение электронного лабораторного журнала на английском языке;
• самостоятельная регистрация своих результатов на приборах ЯМР, ГХ и ВЭЖХ-МС (после обучения).

📌Требования:
• химическое образование со специализацией в области органического синтеза;
• знание современных методов органического синтеза;
• опыт практической работы в лаборатории в области органического синтеза, умение самостоятельно выполнять синтезы, контролировать прохождение реакций, выделять продукт (перегонкой, перекристаллизацией, колоночной хроматографией);
• умение анализировать полученные аналитические данные: ЯМР, ВЭЖХ-МС;
• умение находить и анализировать профильную научную литературу;
• работоспособность и самомотивация;
• владение английским языком на уровне чтения литературы и написания синтетических процедур;
• общая компьютерная грамотность.

📌Условия работы:
• официальное трудоустройство, полная занятость, график работы по согласованию
• 12 минут пешком от м. Кунцевская
• работа в современной хорошо оснащенной лаборатории (импортное стекло, хорошие роторные испарители, вакуумные станции, автоматическая хроматография и др.)
• большой парк аналитических приборов (спектрофотометры, газовые и жидкостные хроматографы, ЯМР, HRMS, MALDI и др.)
• красивая, интересная и разнообразная химия флуоресцентных красителей и других соединений, действительно нужных и полезных людям
• премия по результатам работы, начисляемая по заранее оговоренным правилам за выполнение синтезов, чистоту продукта, выполнение разработок (от 20000 руб. в месяц при эффективной работе).

✅Откликнуться на вакансию можно по ссылке: bit.ly/3q1N6qS
В отклике указать:
— ФИО и номер вакансии (832) в теме письма
— короткий сопроводительный текст о себе
— ответ в теле письма на тестовый вопрос:

❓Какие реакции и реагенты Вы будете использовать для того, чтобы из 3-хлор-4-бром-5-метоксианилина получить 2-бром-3-хлоранизол?

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

24 May 2023 17:00

🔔Сегодня в 19:00 (мск) пройдет II вебинар из мини-серии по микробиомике человека!

Занятие «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» проведет Станислав Кошечкин, к.б.н.
генеральный директор Knomx, советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса Бластима по NGS.

До встречи на вебинаре!

Бластим: курсы и работа в биотехе

22 May 2023 15:26

24 мая в 19:00 пройдет II вебинар «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» из мини-курса по анализу микробиома человека.

Спикером выступит Станислав Кошечкин, к.б.н., генеральный директор Knomx, Советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса «анализ NGS-данных» от Бластим

На занятии вы узнаете:

— Как работает метод 16S секвенирования и какие есть платформы
— Узкие места метода и зачем нужен контроль качества преаналитического и лабораторного этапов
— Практические рекомендации для обработки биобанка микробиоты

А также научитесь:

— Планировать лабораторный этап обработки биобанка микробиоты
— Теоретическим основам метода секвенирования 16S рРНК
— Оценивать техническое описание при изучении публикаций

✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: bit.ly/45kjFAD

Бластим: курсы и работа в биотехе

19 May 2023 19:05

🎓Подборка PhD-позиций за рубежом!

🇸🇪PhD-позиция в структурной биоинформатике (Швеция)
Линчепингский университет приглашает аспирантов для работы в области структурной биоинформатики и изучения биомолекулярных структур с помощью ИИ. Необходимо знание методов искусственного интеллекта и машинного обучения, а также опыт их применения в структурной биоинформатике или смежных областях, знакомство с AlphaFold, знание Python и/или C++, опыт работы с BASH и командной строкой.
Дедлайн: 26 мая
Подробнее: bit.ly/42LBJll

🇩🇪PhD-позиции в протеомику и масс-спектрометрию (Германия)
Приглашаются докторанты и постдоки в лабораторию Тензера в Университетский медицинский центр Майнцского университета для работы по клинической протеомике. Требуется опыт в ЖХ/МС, интерес к биомедицине и биомаркерам, приветствуются знания Python, R, матмоделирования.
Дедлайн: 29 мая
Подробнее: bit.ly/3Igpbu8

🇩🇰PhD-стипендиальная программа в биоинформатику и анализ данных (Дания)
На кафедру биотехнологии и биомедицины Технического университета в Копенгагене нужен PhD-студент для исследования механизмов клеточной дифференцировки. Предстоит заниматься геномикой одиночных клеток (scRNA-seq, scATAC-seq, пространственная транскриптомика) и массовых наборов данных (РНК-/ATAC-/ChIP-seq). Нужна магистерская степень в области биоинформатики, биостатистики, подтвержденный опыт анализа и интерпретации данных секвенирования отдельных клеток, настройки Nextflow, Snakemake, знание Python или R. Длительность 3 года.
Дедлайн: 2 июня
Подробнее: bit.ly/3pIUx69

🇩🇪PhD-студент в Институт физиологии (Германия)
Университетская клиника Карла Густава Каруса в Дрездене приглашает в аспирантуру в проект по изучению роли бета-клеток в гомеостазе глюкозы. Предстоит работать с животными и клеточными моделями, использовать гистологические, биохимические методы и визуализацию. От соискателей требуется степень магистра, опыт работы с животными моделями.
Дедлайн: 15 июня
Подробнее: bit.ly/3MbPzXq

🇧🇪PhD-студент в центр системной биологии растений (Бельгия)
Лаборатория Алена Гуссенса приглашает выпускников магистратуры изучать фосфопротеом при стресс-индуцируемом жасмонатном сигналинге растений. Предстоит применять передовые методы изучения белок-белковых взаимодействий, подходы метаболомики, редактирования генов и микроскопии.
Подробнее: bit.ly/3M5ZLR6

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

18 May 2023 10:00

Советуем канал «Инновации в фармацевтике». Там надежная и проверенная информация про доказательные подходы в медицине и фармацевтике!

Команда ученых и научных журналистов публикует топовые новости фармы в России и в мире из достоверных и авторитетных источников, следит за важнейшими открытиями в отрасли, развенчивает мифы о болезнях и методах их лечения, рассказывает о громких успехах и сокрушительных провалах препаратов ведущих производителей.

Подписчики канала уже узнали:

💊Почему Индия становится ведущим мировым фармацевтическим центром
🦻Как умный наушник поможет быстрее восстановиться после инсульта
💉Почему Merck и Eisai решили прекратить клинические исследования передовой терапии меланомы
🩸Как третий человек в мире полностью излечился от ВИЧ при помощи стволовых клеток костного мозга

Еще на канале выходят дайджесты новостей FDA — американского регулятора, который зачастую определяет судьбу лекарственных средств на мировом фармацевтическом рынке и тенденции в отрасли на годы вперед. Вот третий выпуск!

🔗Подписывайтесь на канал Chemrarpharma и будьте в курсе самых свежих новостей в индустрии

#бластим_рекомендация

Бластим: курсы и работа в биотехе

16 May 2023 18:22

Как найти позицию, которая будет отвечать всем запросам — интересные задачи, справедливая оплата, классная команда? Бластим собирает первую виртуальную Ярмарку вакансий! Приходи и получи шанс найти идеальную работу в биотехе!

В программе:

🖥 Тематические онлайн сессии, на которых представители компаний расскажут об открытых вакансиях, условиях работы в команде, стажировках и учебных программах
🤝 Участники-соискатели смогут пообщаться с нанимающими менеджерами, задать вопросы об условиях работы и требованиях к кандидатам, а также оставить свои контакты и познакомиться с потенциальными работодателями
📝 Все презентации компаний-участниц с контактными данными будут опубликованы на платформе мероприятия и доступны после окончания Ярмарки

Кому подойдет?

🧬Мероприятие идеально для ученых, биологов, агротех-специалистов, аналитиков и всех, кто ищет работу в области биотехнологий или хочет ближе познакомиться с ведущими компаниями в индустрии

Как принять участие?

1 – Зарегистрируйтесь для участия в Ярмарке: bit.ly/3M4o8P4
2 – Следите за обновлениями на сайте и в наших социальных сетях
3 – Обновите резюме в базе Бластима
4 – Подготовьте вопросы для представителей компаний

🎪Дата и время проведения: 27 мая с 10:00 до 17:00
Сохраняйте себе во всех календариках и зовите друзей!

Бластим: курсы и работа в биотехе

15 May 2023 18:03

17 мая в 19:00 (мск) пройдет первый вебинар «Сбор данных и биобанка: клинический этап» из мини-курса по анализу микробиома человека методом секвенирования 16S рРНК бактерий.

Спикером выступит Владимир Романов, менеджер клинических исследований компании Nobias Technologies.

На занятии вы узнаете:

🧫Чем отличается микробиомный проект от обычного клинического исследования
🧬Какое место в структуре проекта должна занимать метагеномика
📝Каким образом должны выглядеть результаты клинической части исследования микробиоты

А также научитесь:

🦠Правильно планировать микробиомное исследование
🏥Собирать клинические данные, чтобы ничего не потерять
🔬Оформлять биобанк микробиома для дальнейшего изучения в лаборатории

✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: https://bit.ly/3I9VgDT
Всем, кто будет онлайн, подарим шаблон синопсиса клинического исследования!

Бластим: курсы и работа в биотехе

14 May 2023 12:40

Наполним выходные наукой вместе с Бластимом!

🧠Стандарт терапии болезни Паркинсона — пероральный прием L-дофы. Молекула преодолевает гематоэнцефалический барьер и, метаболизируясь в дофамин, компенсирует его недостаток в мозге. Однако проблема такого лечения — постоянные колебания уровня дофы в плазме, приводящие к лекарственной дискинезии. В Nature Communications авторы предложили новый способ терапии нейродегенерации: заменить в дофаминовых нейронах инактивированную тирозингидроксилазу — фермент, превращающий дофу в нейромедиатор дофамин — на нанозим! За основу ученые взяли наночастицы железа Fe3O4, которые имитируют каталитический центр естественного фермента. Чтобы происходило распознавание субстрата, к наночастицам был присоединен нуклеотидный аптамер к тирозину. Кроме того, для эффективного прохождения ГЭБ и нацеливания именно на больные нервные клетки ученые пришили еще один аптамер — к рецептору трансферрина. И, наконец, последним к конструкции добавили антисмысловой олигонуклеотид к мРНК α-синуклеина. Он был необходим, чтобы нанозим реагировал на сверхэкспрессию ключевого маркера нейродегенерации. Проверка искусственного фермента на клеточных и мышиных моделях паркинсонизма показала отличные результаты.
https://www.nature.com/articles/s41467-023-38323-w

🧼Комары питаются нектаром и кровью. В поиске жертв кровососущие самки насекомых ориентируются на ореол летучих органических соединений, испускаемых их хозяевами. Пахучие молекулы — продукты метаболизма самих животных и их микробиоты. А в случае с людьми в дело вмешиваются еще и духи, мыла, порошки. Эти средства содержат множество соединений и часто по запаху имитируют цветочные ароматы. Американские исследователи решили проверить, как средства гигиены влияют на привлекательность человека для кровососущих. Ученые взяли 4 мыла самых популярных марок в США и жёлтолихорадочных комаров Aedes aegypti. Испытуемые носили нейлоновые нарукавники, после чего пробы воздуха вокруг повязок анализировались с помощью ГХ-МС. Также оценивали притягательность запаха для комаров по числу посадок на нарукавники. Мыла действительно влияли на привлечение кровососов: после мытья рук происходил сдвиг в профиле запаха человека в пользу химических веществ растительного происхождения. Кроме того, специалистам удалось идентифицировать, какие именно соединения привлекают комаров. Но, конечно, куда любопытнее узнать о репеллентах: отталкивают кровососов бензилбензоат (компонент аромата цветов, используемый в лечении педикулеза), γ-ноналактон (аромат арбуза) и бензальдегид (запах миндаля).
https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(23)00744-7

🌍Пшеница, рис и кукуруза — три кита, на которых держится все сельское хозяйство. Однако чрезмерная зависимость от нескольких зерновых не обеспечивает продовольственную безопасность. Сегодня ученые присматриваются к так называемым «сиротским» культурам, имеющим региональное значение, но не представленным в мировой сельхозпрактике. Африка — кладезь таких перспективных видов, но пока местная наука испытывает проблемы с современным оборудованием для изучения генетических ресурсов. На этот раз в коллаборации с западными коллегами африканские ученые занялись лаблабом. Это бобовое растение выращивается в тропиках, где активно используется в пищу и на корм скоту. Лаблаб питателен и засухоустойчив. Генетики, используя недорогие портативные платформы для секвенирования с длинными ридами, прочитали геном лаблаба. Они определили расположение локусов важных агрономических признаков, а также кластеров нежелательных генов ингибиторов трипсина, изучили мобилом, установили два события одомашнивания. Новые данные позволят вести эффективную геномную селекцию, в частности на уменьшение антипитательных свойств при сохранении высокого адаптивного потенциала.
https://www.nature.com/articles/s41467-023-37489-7

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

11 May 2023 17:57

⚡️Вебинар «Начни программировать на Python: возможности для биологов» стартует через пару минут!
Все, кто хочет попасть на эфир, еще могут успеть получить ссылку.
Регистрируйтесь прямо сейчас: bit.ly/3LT5KIV

Бластим: курсы и работа в биотехе

10 May 2023 18:55

Меньше, чем через неделю, стартует «Python для новичков», и нас очень много спрашивают про организацию и программу курса. На карточках мы собрали ответы на самые популярные вопросы.

⚡Если вы хотите больше узнать о возможностях питона для биологов, приходите завтра на наш вебинар в 19.00 по МСК. Вход свободный, регистрация по ссылке: bit.ly/3BjRO5C

#бластим_питон

Бластим: курсы и работа в биотехе

05 May 2023 17:01

Нам часто задают вопрос, можно ли устроиться на стажировку или работу после наших курсов. Короткий ответ: очень вероятно, что да. Но конечно же, многое зависит от соискателя, от умения себя подать в резюме, а также от типа вакансии. Для вашего удобства подобрали несколько хороших вариантов для биоинформатиков. Надеемся, каждый найдет себе по душе.

🇵🇱Оплачиваемая стажировка по биоинформатике в Ardigen (Краков, Польша)
На стажировке предстоит оказывать биоинформатическую поддержку приложений для персонализированной терапии рака. Требования к соискателям: нужно быть студентом магистратуры или выпускником в области биоинформатики/молбиологии/биотехнологии/информатики или смежных, иметь базовое понимание рабочих процессов анализа NGS-данных, а также навыки на Python. Формат гибридный.
Дедлайн: 29 мая
bit.ly/3AYCtYo

🇩🇪PhD-студент в институт Роберт Коха (Бранденбург, Германия)
Приглашаются кандидаты со степенью магистра для работы и написания диссертации в области ИИ в здравоохранении. Требуется опыт количественного анализа сложных массивов данных с использованием Python или Java. Приветствуются знания в сфере ИИ.
Дедлайн: 30 мая
bit.ly/41odM2l

🇱🇺Разработчик ПО в Центр Системной Медицины (Люксембург)
Предстоит создать платформу для управления и анализа данных пациентов. Необходима степень магистра, в идеале в области, связанной с IT, отличное знание Python или Java, а также 4+ лет опыта в качестве разработчика.
Дедлайн: 2 июня
bit.ly/42eQpJO

🇳🇴Постдок в биоинформатику в Институт исследования рака (Осло, Норвегия)
Приглашается биоинформатик в проект по изучению роли регуляторных Т-клеток в микроокружении опухоли путем scRNA-seq, пространственной транскриптомики и протеомики. Нужна степень PhD в области биоинформатики, вычислительной биологии, информатики и смежных, знание Linux, а также Python и R, основ ML, опыт анализа и интеграции мультиомных данных.
Дедлайн: 13 июня
bit.ly/413jzKt

🇺🇸Старший менеджер в протеомику в Freenome (Калифорния, США)
Freenome занимается онкодиагностикой по биомаркерам крови. В стартап требуется менеджер для поддержания мультиомиксной платформы. От соискателя нужна PhD-степень в области биоинформатики, опыт в постановке экспериментов в протеомике с использованием Python/R, навыки руководства коллективом, знания статистики.
bit.ly/3LWqOj0

🇧🇪Биоинформатик в Orionis Biosciences (Гент, Бельгия)
Стартап создает платформу для скрининга новых лекарств против рака. От кандидата: степень бакалавра в области биоинформатики, наук о жизни, информатики или прикладной математики. Нужны продвинутые навыки программирования (Python) и опыт работы с базами данных (PostgreSQL), AWS и Docker.
bit.ly/416E7li

🇩🇪Стажер в вычислительную биологию в Dewpoint (Дрезден, Германия)
Разыскивается стажер, который присоединится к команде генетиков и вычислительных биологов. Предстоит применять мультиомные данные к разработке лекарств. Стажеры будут изучать концепции датасайнс в биоинформатике. Нужна степень магистра, хорошее знание статистики, опыт в R или Python.
bit.ly/3HDUmz5

🇩🇪Стажировка в KWS (Айнбек, Германия)
KWS — компания по селекции растений — приглашает бакалавров и магистров на оплачиваемую стажировку. Предстоит проводить молекулярные исследования в лабораториях по разным направлениям, в том числе биоинформатике.
bit.ly/3HDQEG0

🇫🇷Стажировка по машинному обучению в Owkin (Париж, Франция)
Owkin — биотех-стартап, который применяет искусственный интеллект для разработки новых лекарств. Компания приглашает на стажировку, которая будет посвящена приложению федеративного обучения к генетическим данным. Нужен опыт работы в ML, навыки в Linux/Unix и Python, а также знание фреймворков DL (Tensorflow, PyTorch).
bit.ly/3AXnX2V

#бластим_подборка

Бластим: курсы и работа в биотехе

04 May 2023 08:49

«Геномед» — это инновационная компания с командой врачей-генетиков и неврологов, акушеров-гинекологов и онкологов, биоинформатиков и лабораторных специалистов, предоставляющая комплексную и высокоточную диагностику наследственных заболеваний, нарушений репродуктивной функции, подбор индивидуальной терапии в онкологии.

Компания в сотрудничестве с мировыми лидерами в области молекулярной диагностики предлагает более 200 молекулярно-генетических исследований, основанных на самых современных технологиях. Использование секвенирования нового поколения, микроматричного анализа с мощными методами биоинформатического анализа позволяют быстро поставить диагноз и подобрать правильное лечение даже в самых сложных случаях.

Миссия «Геномеда» заключается в предоставлении врачам и пациентам комплексных и экономически эффективных генетических исследований, информационной и консультационной поддержки 24 часа в сутки.

В команду «Геномеда» требуется руководитель R&D-отдела.

Обязанности:
🔸Ведение проектов R&D и управление ими, планирование работы R&D, руководство отделом R&D, построение команды;
🔸Организация и участие в разработке тест-систем для ДНК(РНК)-диагностики (на основе NGS/Microarray), их внедрение в работу лаборатории и валидация;
🔸Решение нетривиальных задач, возникающих в ходе рутинной диагностики;
🔸Участие в процессе внедрения новых методов и оборудования в рутинную работу лаборатории, поиск новых решений;
🔸Отчетность перед руководством.

Требования:
🔺Опыт работы в области молекулярной биологии/генетики не менее 3 лет;
🔺Опыт работы в проектах/команде R&D;
🔺Наличие управленческих/организационных навыков;
🔺Систематический подход к ведению работы;
🔺Готовность работать в команде.

Условия:
🔹Работа в лидирующей компании в области генетических исследований;
🔹Стабильная заработная плата, оформление согласно ТК РФ;
🔹Место работы: Короленко, д. 8, метро «Сокольники»;
🔹Возможность освоения современных диагностических методов;
🔹Возможность участия в научных проектах и разработках.

Откликнуться на вакансию: bit.ly/3NDNkP0

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

03 May 2023 10:33

Поздравляем с праздниками и анонсируем розыгрыш призов!

Сегодня последний День Открытых дверей, мы собираем заявки и разыгрываем скидки среди тех, кто зарегистрируется до 12:30 (мск).

Уже почти 400 человек получили бесплатный доступ к избранным лекциям наших курсов (всего 106 часов) и примут участие в лотерее, где можно выиграть выгодные скидки на предстоящие программы! Никто не уйдет без подарка!

Совсем скоро пройдет розыгрыш призовых скидок, спешите присоединиться к акции: bit.ly/3HyifIl
Промокоды будут действовать до пятницы.

Бластим: курсы и работа в биотехе

30 April 2023 15:12

Свежая порция новостей науки от Бластима для чтения на выходных!

🌱Карликовые и полукарликовые сорта пшеницы с подавленным гибберелиновым сигналингом устойчивы к полеганию и во многом обеспечили Зеленую революцию 1960-х. Однако нарушение фитогормонального баланса не проходит даром: растения с коротким стеблем имеют низкую эффективность усвоения азота и фиксации углерода, что приводит к снижению биомассы, размера колоса и веса зерна. Для поддержания высокой урожайности необходимо обильное азотное питание. Это требует внесения большого количества удобрений, что наносит ущерб окружающей среде. На этот раз ученые решили пойти иным путем и сделать редизайн полукарликовых сортов пшеницы без использования традиционных аллелей зеленой революции. Специалисты использовали природных мутантов с редкой делецией генов восприятия других гормонов — брассиностероидов, которые также вовлечены в контроль многих агрономических признаков. Им удалось получить компактные растения с куда лучшей урожайностью. Генетики предлагают получать такие короткостебельные сорта пшеницы и прочих зерновых для сельского хозяйства с помощью CRISPR-Cas9!
Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41586-023-06023-6

🐸Некоторые виды, например, ядовитые лягушки-древолазы, предпочитают не прятаться от хищников, а отпугивать их предостерегающей окраской. Это называется апосематизмом, и проблема развития такой адаптивной стратегии давно беспокоит биологов. Действительно, как в популяции может закрепиться признак вызывающей окраски, если первая же особь-мутант станет легкой мишенью для хищников, которые не могут сразу распознать ее несъедобность или ядовитость? Статья в Science как раз на примере амфибий описывает эволюционную траекторию перехода от камуфляжной окраски к пестрой. Канадские и южнокорейские исследователи предполагают, что существуют промежуточные этапы между маскировкой к апосематизмом. В переходном состоянии демонстрация предупреждающего окраса хищникам происходит при непосредственном контакте, поскольку у таких земноводных с химзащитой ярко окрашены только конечности или брюхо.
Подробнее: https://www.science.org/doi/10.1126/science.ade5156

🍴Нервная анорексия — серьезное расстройство пищевого поведения. Несмотря на высокую летальность, пока заболевание описано как набор симптомов, а его этиология неясна. Известно, что в патогенезе участвуют как средовые факторы, так и генетика. В материале в Nature Microbiology датские ученые с помощью метагеномики фекальной микробиоты и метаболомики крови изучили, какую роль играют микробиом и виром кишечника в развитии болезни. Им удалось показать что кишечные микробы через метаболиты крови способны влиять на процессы контроля мозгом аппетита, эмоций и поведения. Например, бактерии у женщин с нервной анорексией производят меньше витамина B1, дефицит которого связан с психофизиологическими нарушениям. Кроме того, микробиом пациенток был обогащен биохимическими путями деградации нейромедиаторов. А в сыворотке крови оказалось повышено количество соединений, связанных с регуляцией насыщения: желчных кислот и производных триптофана. Роль бактерий в патогенезе анорексии подтвердилась и в экспериментах с трансплантацией фекальной микробиоты человека мышам.
Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41564-023-01355-5

Кстати, напоминаем, что в мае у Бластима пройдет серия вебинаров по микробиомике человека. Записывайтесь: bit.ly/3LGVkNC

#выходные_у_бластим